На рынке образовательных услуг Узбекистана Андижанский государственный медицинский институт функционирует с 1955 года. За полвека существования данный вуз успешно зарекомендовал себя в республике и за её пределами, подготовил свыше 5000 высококвалифицированных специалистов-медиков общего профиля, 452 клинических ординаторов, 109 аспирантов, 13 докторантов. Сегодня он занимает одну из ведущих позиций среди вузов Узбекистана.
Образовательный процесс в АГМИ осуществляется на следующих факультетах:
Лечебный факультет, Педиатрический факультет, Факультет медицинской педагогики, Факультет подготовки медицинских сестёр высшей квалификации, Факультет усовершенствования врачей. Учебно-воспитательным процессом в институте руководят 452 преподавателей, из числа которых 54 докторов наук, профессоров, 180 кандидатов наук, доцентов. Также при университете функционирует магистратура. Кафедры АГМИ располагаются в клинике института и в других больницах облздрава, которые оборудованы современными техническими средствами. В клинике института используется новейшее диагностическое оборудование (МРТ, допплер, сканер, эндоскоп и др.). В Андижанском государственном медицинском институте имеются все необходимые условия проведения учебного процесса и научно-исследовательской работы на высочайшем уровне. К примеру, в распоряжении института находятся 300 современных компьютеров, мини-типография, сканер, цветной принтер и ксероксы, 4 компьютерных класса и 12 систем Интернета. Свои услуги также предоставляет библиотека института, книжный фонд которой насчитывает 286000 экземпляров. Большое внимание в вузе также уделяется международному сотрудничеству, в настоящее время стабильные и прочные связи установлены со следующими вузами:
Российским медицинским университетом, Российской академией постдипломного обучения, Санкт-Петербургской академией постдипломного обучения, Киевской медицинской академией, Волгоградской медицинской академией, Новосибирским медицинским университетом.